明朝年间，天下第一富商沈世杰临终前以奇门遁甲之术建造天机宝库封存巨额财富，不料死后竟被贼人环伺劫掠了沈家后人沈雨馨，段十一郎为救沈雨馨以及保卫天机宝库，召集江湖侠客深入西域荒漠，一路披荆斩棘，正邪两派

本片改编自花泽健吾的同名漫画，讲述了曾经辉煌一时的日本忍者，在战后被 解散组织而消失，不过，他们潜伏在世界的所有机关，现代也暗中活动着，据说人数约为20万人。但基层忍者经常找不到工作，其中之一的云